La commune est mentionnée dès 1216 sous la forme latinisée Thorreia puis Torrea en 1258, Thorreya vers 1330 et Torrée en 1399. En 1936, le village devient Thorée-les-Pins, par adjonction du déterminant complémentaire -les-Pins en référence aux vastes espaces forestiers qui recouvrent la commune.
Le toponyme Thorée est issu de Tauriaca, du nom d’un propriétaire terrien de l’époque gallo-romaine dénommé Taurius.